На протяжении всех лет и в настоящее время ФГАНУ "ВНИМИ" проводит фундаментальные и прикладные исследования, направленные на создание новых и совершенствование традиционных технологий переработки молока, упаковочных материалов, моющих и дезинфицирующих средств, оборудования, приборов и средств управления для молочной промышленности, а также занимается решением проблем в области микробиологии, технохимконтроля, санитарии и экологии, стандартизации, метрологии и патентно-лицензионных работ.